許多研究表明，小豬對飼料抗原過敏是斷奶仔豬腹瀉的最終原因。在腸道緊密連接打開的情況下，或者腸粘膜受損的情況下，一些本來不能進入腸壁的日糧抗原，大分子營養成分，細菌抗原，毒素等大分子物質進入粘膜下層，激發免疫反應，這不光是引起腹瀉的原因，而且還是引起糖尿病、克羅恩氏病、脂瀉病、結腸炎、潰瘍性腸病、類風濕等疾病的原因。
未消化的蛋白和未吸收的氨基酸進入大腸后，會使大腸中大腸桿菌等糖蛋白水解菌數量增加。這些菌分解蛋白產生尸胺、腐胺、組胺、酪胺等毒素。
這些毒素分刺激腸壁，引起消化功能紊亂。組胺進入血液后，會引起組織水腫，包括小腸絨毛水腫。
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